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Examinar el contenido de GC ( número de G y C 's) en su secuencia del cebador . GC unión es más fuerte que AT unión debido al enlace de hidrógeno adicional entre la guanina y citosina . Unión óptima es al menos un 50 por ciento de contenido GC .
2
Examine la temperatura de hibridación de la reacción. Las bajas temperaturas de recocido, generalmente definidos como 55 C o menos , pueden hacer que la unión no específica de la imprimación , que puede causar dímeros de cebadores , además de la amplificación de las secciones genómicas incorrectos .
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Doble -check la cantidad y la concentración de los cebadores que agregó a la PCR . Un exceso de cebadores , por lo general más de 75 picomoles , puede causar dímeros de cebadores , también.