¿Cuáles son los efectos de un pH alcalino en la estructura del ADN ?

Ordinariamente cada molécula de ADN dentro de las células contiene dos cadenas unidas entre sí mediante interacciones llamados puentes de hidrógeno . Cambio de las condiciones , sin embargo , puede & quot ; desnaturalizar & quot ; el ADN y causar estas hebras se separen. La adición de bases fuertes , como NaOH, el pH aumenta drásticamente , disminuyendo así la concentración de iones hidrógeno de la solución y desnaturalización de ADN de doble cadena. Efectos de pH

La concentración de iones de hidróxido y el pH tienen una correlación directa , es decir, cuanto mayor sea el pH , mayor es la concentración de hidróxido . Asimismo, la menor cae la concentración de iones de hidrógeno. A pH alto , a continuación , la solución es rica en iones de hidróxido , y estos iones cargados negativamente puede tirar de iones de hidrógeno fuera de moléculas como los pares de bases en el ADN . Este proceso altera la unión de hidrógeno que contiene las dos cadenas de ADN juntos, haciendo que se separen.
ARN frente a ADN

A diferencia de ARN, ADN carece de un grupo hidroxilo en la posición 2 ' en cada grupo de azúcar . Esta diferencia hace que el ADN mucho más estable en solución alcalina . En el ARN , el grupo hidroxilo en la posición 2 ' puede renunciar a un ion de hidrógeno a la solución a pH alto , creando un ion alcóxido altamente reactivo que ataca el grupo fosfato que sostiene dos nucleótidos vecinos juntos. ADN no sufre de este defecto y por lo tanto goza de una notable estabilidad a pH alto .
Alcalina Lisis

Los biólogos moleculares a menudo hacen uso de desnaturalización alcalina para aislar el plásmido ADN de las bacterias. Los plásmidos son pequeños bucles de ADN se separan del cromosoma bacteriano . En una miniprep de lisis alcalina , los biólogos detergente y añadir hidróxido de sodio a las bacterias suspendidas en solución. El detergente se disuelve la membrana celular bacteriana mientras que el hidróxido de sodio aumenta el pH y hace que la solución altamente alcalina. Como las células rotas liberan su contenido , el ADN se separa en el interior de sus hilos componentes, o desnaturaliza .
Reasociación

Una vez que el biólogo extrae el ADN de la célula, se agrega otro reactivo para volver la solución a un pH más neutro y precipitar el detergente. El cambio de pH permite que las hebras de plásmido a rehibridar ; el cromosoma voluminosos , sin embargo, no puede hacer lo mismo , por lo que el biólogo puede quitarlo junto con el detergente, proteínas desnaturalizadas y otra chatarra variada , dejando el plásmido atrás. Lisis alcalina no purificar completamente el ADN del plásmido ; más bien sirve como un & quot ; rápido y sucio & quot ; manera de extraerlo de la célula y eliminar la mayoría de los otros contaminantes .